مقایسه کامپیوتری اپیتوپ های نواحی c۲-v۳-c۳ گلیکوپروتئین ۱۲۰gp ایزوله ایرانی h iv-۱با نواحی همولوگ در زیرگونه های گوناگون این ویروس
نویسندگان
چکیده
در تحقیق حاضر اپیتوپ های پیش بینی شده در نواحی c2-v3-c3در۱۲۰ gp ایزوله ایرانی ویروس 1 hiv-بااپیتوپ های نواحی مشابه در زیرگونه های a تا i این ویروس مقایسه شده اند. از آن جا که نواحی اپیتوپ یک پروتئین مناطقی فاقد ساختمان ثانویه و آب دوست هستند که در تماس با محلول آبی اند از این فاکتورها برای پیش بینی اپیتوپ ها استفاده شد. تعداد نواحی هلیکس(١) و شیت ها(٥) درایزوله ایرانی با تعداد آن ها در زیرگونه f و aبرابر بود. روش هوبارد٧ محل بالقوه گلیکوزیلاسیون را در ایزوله ایرانی تعیین کرد. در تمام زیرگونه های دیگر تعداد محل های بالقوه گلیکوزیلاسیون کم تر از ٧ بود. در تمام ایزوله ها از جمله ایزوله ایرانی، یک اپیتوپ در یک ناحیه مشابه پیش بینی شد. در تمام نواحی بررسی شده (به جز ایزوله ایرانی و زیرگونه های d و h) یک اپیتوپ طویل واحد در ناحیه ای دیگر پیش بینی شد. در زیرگونه h هیچ اپیتوپی در این ناحیه پیش بینی نشد. در ایزوله ایرانی و درزیرگونه dدو اپیتوپ کوتاه در این ناحیه پیش بینی شد. آنالیز کامپیوتری، شباهت ها و تفاوت های بین موقعیت اپیتوپ های زیرگونه ایرانی و سایر ویروس های hiv-1 پیش بینی کرد. اگر چه ساختار اولیه ۱۲۰ gpزیرگونه ایرانی به زیرگونه b نزدیک است، برخی تفاوت ها بین ساختار دوم وسوم این ویروس و ساب تیپ b پیش بینی می شوند.
منابع مشابه
بیان اپیتوپ G1 از ژن گلیکوپروتئین G ویروس تب بی دوام گاوی توسط سازه نوترکیب pET24-G1 در اشرشیاکلی
تب بیدوام گاوی (BEF) یک بیماری ویروسی در گاو و گاومیش است که در سالهای اخیر در برخی از استانهای ایران به ویژه مناطق جنوبی و گرم دیده شده است. گلیکوپروتئین G، آنتیژن اصلی حفاظتی ویروس تب بیدوام گاوی (BEFV) و هدف آنتیبادیهای خنثی کننده ضدویروسی است. هدف از مطالعهی حاضر، کلونینگ و بیان اپیتوپ G1 از ژن گلیکوپروتئین G ویروس BEF در یک سیستم پروکاریوتی بود. به این منظور، اپیتوپ G1 درو...
متن کاملطراحی پلاسمید یوکاریوتی بیان کننده اپیتوپ G1 از ژن گلیکوپروتئین G ویروس تب بی دوام گاوی در سلول های جنینی کلیه انسان
گلیکوپروتئین G ویروس تب بیدوام گاوی (BEFV) به عنوان یک نامزد احتمالی جهت ایمنسازی حیوانات در برابر بیماری تب بیدوام شناخته شده است. در سالهای اخیر، این پروتئین جهت تولید یک واکسن نوترکیب مورد توجه ویژه بوده است. هدف از مطالعهی حاضر، ساخت یک پلاسمید یوکاریوتی بیان کنندهی اپیتوپ G1 از ژن گلیکوپروتئین G ویروس تب بیدوام گاوی، برای استفاده به عنوان یک واکسن DNA احتمالی در مطا...
متن کاملپایش مقایسه ای کلاد های غالب زوگرانتله های همزیست با مرجان های آبسنگ ساز نواحی شرقی جزیره کیش(خلیج فارس)
سابقه و هدف: Symbiodinium جلبک تک سلولی دو تاژکی است که با تعدادی از بی مهرگان هم زیستی دارد و تاکنون 9 کلاد از آن با روش های مولکولی شناسایی شده است. کلادهای مختلف Symbiodinium خصوصیات فیزیولوژیکی متنوعی دارند که می‌توانند تأثیرات متفاوتی بر دوام و بقای میزبان آن ها در برابر شرایط مختلف محیطی و موقعیت‌های جغرافیایی داشته باشند. در این تحقیق، کلادهای زوگزانتله هم زیست با مرجان های آبسنگ ساز در ...
متن کاملتحلیل و ارزیابی شاخص های زیست پذیری در نواحی شهری مطالعه موردی: نواحی 23 گانه شهر زنجان
امروزه شهرها با چالشهای بسیاری در زمینههای اقتصادی، اجتماعی و زیست محیطی مواجه هستند. در عین حال افزایش جمعیت به همراه نسبت روزافزون شهرنشینی پیامدهای زیان باری برای شهرها به ارمغان آورده است. تداوم این گونه رشد شهرنشینی با مشکلات اجتماعی، اقتصادی و زیست محیطی، بحران آفرین و هشداری بر ناپایداری شهرها میباشد. بنابرین ضرورت بحث زیستپذیری و توسعه پایدار امروزه در شهرها کاملاً نمایان است. پژوهش ...
متن کاملبررسی تاثیر زمان و شیوه های گوناگون پایدارسازی و رنگ آمیزی بر ویژگی های هیستومورفیکِ نواحی گوناگون مری گوسفند
هدف از انجام این پژوهش، مقایسه ی تأثیر زمان و روش های گوناگون پایدارسازی و رنگ آمیزی بر روی ویژگی های هیستومورفیک نواحی گوناگون در مری گوسفند بوده است. جهت انجام این پژوهش، 5 رأس گوسفند ماده ی بالغ از نژاد لری بختیاری انتخاب و پس از کشتار، مری از بافت های اطراف جدا شده و از هر یک از نواحی ابتدایی، میانی و انتهایی،3 نمونه در محلول فرمالین 10% و محلول بوئن، غوطه ور شد. بعد از گذشت24 و 48 ساعت و 1...
15 صفحه اولمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
علومجلد ۱۸، شماره ۴۷، صفحات ۱۷۱-۱۸۰
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023